تبدأ قصة هذا الأنيمي عندما يهاجم الثعلب ذو التسعة ذيول قرية الورقة ويدمره وينشر فيها الدمار
فيقرر أهل القرية إرسال العديد من مقاتلي النينجا للقضاء على هذا الثعلب الشرير لكنه يقوم بتلقين هؤلاء النينجا درسا قاسياً جداً فيضطرون في هذه الحالة للأستعانة بأقوى مقاتل نينجا في المسلسل هوكاج الرابع Yondaime
فيقوم هذا الأخير بحبس هذا الثعلب في بطن أحد مواليد أهل
القرية الجدد .... ( ناروتو ) وبعد 12 عاماً من الحادثة ... تبدأ الحكاية ....... وتظهر شخصيات مثل Orochimaru و Itachi تسعى وراء طرق شريرة .